Le FC Nantes a disputé 26 campagnes en Coupe de la Ligue. Le club a atteint à trois reprises le stade des demi-finales : en 2013-2014 face au Paris SG (1-2), en 2000-2001 contre l'OL (3-2), puis lors de l'épopée 2003-2004 menant au Stade de France face au FC Sochaux. Après le succès acquis à Montpellier en 16ème de finale (saison 2018-2019), les "Jaunes-et-Verts" comptabilisent 26 succès en 50 matches disputés depuis 1994/1995.
Le bilan du FC Nantes :
2019 - 2020 : FC Nantes - RC Strasbourg (8ème de finale : 0-1)
2018 - 2019 : Stade Rennais - FC Nantes (8ème de finale : 2-1)
2017 - 2018 : Tours FC - FC Nantes (16ème de finale : 3-1)
2016 - 2017 : FC Nantes - AS Nancy-Lorraine (1/4 de finale : 0-2)
2015 - 2016 : Bourg-en-Bresse - FC Nantes (16ème de finale : 3-2)
2014 - 2015 : LOSC Lille - FC Nantes (quart de finale : 2-0)
2013 - 2014 : FC Nantes - Paris Saint-Germain (demi-finale : 1-2)
2012 - 2013 : Angers SCO - FC Nantes (1er tour : 2-1 a.p.)
2011 - 2012 : CS Sedan - FC Nantes (16ème de finale : 2-0)
2010 - 2011 : US Boulogne CO - FC Nantes (1er tour : 2-2 4 tab Ă 2)
2009 - 2010 : ESTAC Troyes - FC Nantes (1er tour : 4-0)
2008 - 2009 : US Créteil - FC Nantes (16ème de finale : 1-0)
2007 - 2008 : FC Nantes - AS Monaco (16ème de finale : 2-3)
2006 - 2007 : FC Nantes - Toulouse FC (16ème de finale : 0-2)
2005 - 2006 : Girondins de Bordeaux - FC Nantes (8ème de finale : 3-1)
2004 - 2005 : AJ Auxerre - FC Nantes (8ème de finale : 2-1)
2003 - 2004 : FC Nantes - FC Sochaux (finale : 1-1 4 tab Ă 5)
2002 - 2003 : FC Nantes - FC Metz (quart de finale : 0-2)
2001 - 2002 : FC Nantes - SC Bastia (8ème de finale : 1-3)
2000 - 2001 : Olympique Lyonnais - FC Nantes (demi-finale : 3-2)
1999 - 2000 : AS Saint-Etienne - FC Nantes (16ème de finale : 3-1)
1998 - 1999 : FC Metz - FC Nantes (16ème de finale : 1-0)
1997 - 1998 : Montpellier HSC - FC Nantes (16ème de finale : 1-0)
1996 - 1997 : CS Louhans-Cuiseaux - FCN (8ème de finale : 0-0 4 tab à 2)
1995 - 1996 : FC Nantes - EA Guingamp (8ème de finale : 2-3 ap)
1994 - 1995 : FC Nantes - SC Bastia (8ème de finale : 0-1 ap)
Par A.D.